Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgf1P61148 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgf1P61148 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgf1P61148 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fgf1P61148 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgf1P61148 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgf1P61148 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms