Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rims4P60191 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rims4P60191 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rims4P60191 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rims4P60191 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rims4P60191 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rims4P60191 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rims4P60191 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rims4P60191 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rims4P60191 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rims4P60191 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rims4P60191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rims4P60191 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rims4P60191 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rims4P60191 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rims4P60191 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rims4P60191 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms