Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcmtd1P59913 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcmtd1P59913 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pcmtd1P59913 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcmtd1P59913 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms