Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CgnP59242 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CgnP59242 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CgnP59242 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CgnP59242 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CgnP59242 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CgnP59242 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CgnP59242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CgnP59242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CgnP59242 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CgnP59242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CgnP59242 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CgnP59242 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CgnP59242 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CgnP59242 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CgnP59242 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CgnP59242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CgnP59242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CgnP59242 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CgnP59242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CgnP59242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CgnP59242 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CgnP59242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CgnP59242 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CgnP59242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CgnP59242 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CgnP59242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CgnP59242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CgnP59242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CgnP59242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CgnP59242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CgnP59242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CgnP59242 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CgnP59242 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CgnP59242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CgnP59242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CgnP59242 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CgnP59242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CgnP59242 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CgnP59242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CgnP59242 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CgnP59242 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CgnP59242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CgnP59242 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CgnP59242 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CgnP59242 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CgnP59242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CgnP59242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CgnP59242 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CgnP59242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CgnP59242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CgnP59242 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CgnP59242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CgnP59242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CgnP59242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CgnP59242 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CgnP59242 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CgnP59242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CgnP59242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CgnP59242 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CgnP59242 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CgnP59242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CgnP59242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CgnP59242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CgnP59242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CgnP59242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CgnP59242 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CgnP59242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CgnP59242 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CgnP59242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CgnP59242 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CgnP59242 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CgnP59242 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CgnP59242 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CgnP59242 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CgnP59242 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CgnP59242 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CgnP59242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CgnP59242 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms