Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc3P59034 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc3P59034 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc3P59034 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms