Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samsn1P57725 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samsn1P57725 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samsn1P57725 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samsn1P57725 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Samsn1P57725 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms