Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb3P54285 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacnb3P54285 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb3P54285 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacnb3P54285 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cacnb3P54285 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacnb3P54285 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacnb3P54285 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.7 ms