Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XpcP51612 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XpcP51612 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XpcP51612 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XpcP51612 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XpcP51612 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XpcP51612 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XpcP51612 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XpcP51612 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XpcP51612 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XpcP51612 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XpcP51612 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XpcP51612 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
XpcP51612 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XpcP51612 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XpcP51612 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XpcP51612 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XpcP51612 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XpcP51612 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XpcP51612 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XpcP51612 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XpcP51612 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XpcP51612 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
XpcP51612 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XpcP51612 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XpcP51612 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XpcP51612 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XpcP51612 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XpcP51612 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XpcP51612 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XpcP51612 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XpcP51612 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XpcP51612 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XpcP51612 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
XpcP51612 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XpcP51612 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XpcP51612 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XpcP51612 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XpcP51612 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XpcP51612 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XpcP51612 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XpcP51612 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XpcP51612 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XpcP51612 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XpcP51612 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XpcP51612 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XpcP51612 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XpcP51612 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XpcP51612 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XpcP51612 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XpcP51612 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XpcP51612 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XpcP51612 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XpcP51612 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XpcP51612 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XpcP51612 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XpcP51612 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XpcP51612 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XpcP51612 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XpcP51612 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XpcP51612 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XpcP51612 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XpcP51612 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
XpcP51612 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XpcP51612 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XpcP51612 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XpcP51612 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XpcP51612 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XpcP51612 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XpcP51612 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XpcP51612 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XpcP51612 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XpcP51612 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XpcP51612 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XpcP51612 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XpcP51612 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XpcP51612 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XpcP51612 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XpcP51612 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XpcP51612 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XpcP51612 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XpcP51612 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms