Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpiaP47968 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpiaP47968 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpiaP47968 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpiaP47968 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpiaP47968 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpiaP47968 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpiaP47968 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpiaP47968 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpiaP47968 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RpiaP47968 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms