Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc2P46471 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc2P46471 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmc2P46471 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc2P46471 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc2P46471 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc2P46471 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc2P46471 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms