Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ThpoP40226 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ThpoP40226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ThpoP40226 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThpoP40226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThpoP40226 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ThpoP40226 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ThpoP40226 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ThpoP40226 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ThpoP40226 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ThpoP40226 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ThpoP40226 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ThpoP40226 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ThpoP40226 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ThpoP40226 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ThpoP40226 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms