Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox5P35710 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox5P35710 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sox5P35710 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox5P35710 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox5P35710 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox5P35710 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox5P35710 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox5P35710 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox5P35710 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox5P35710 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox5P35710 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox5P35710 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox5P35710 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox5P35710 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox5P35710 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sox5P35710 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox5P35710 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms