Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tacr1P30548 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tacr1P30548 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tacr1P30548 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tacr1P30548 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr1P30548 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms