Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept4P28661 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept4P28661 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept4P28661 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept4P28661 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept4P28661 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept4P28661 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sept4P28661 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sept4P28661 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept4P28661 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept4P28661 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept4P28661 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept4P28661 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept4P28661 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept4P28661 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms