Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmb9P28076 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb9P28076 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb9P28076 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms