Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bmi1P25916 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bmi1P25916 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bmi1P25916 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bmi1P25916 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms