Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsta3P23591 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsta3P23591 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsta3P23591 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsta3P23591 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms