Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fgf6P21658 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf6P21658 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf6P21658 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgf6P21658 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms