Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KitlgP20826 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KitlgP20826 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KitlgP20826 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KitlgP20826 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KitlgP20826 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KitlgP20826 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KitlgP20826 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KitlgP20826 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KitlgP20826 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KitlgP20826 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KitlgP20826 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KitlgP20826 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KitlgP20826 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KitlgP20826 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KitlgP20826 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1539.2 ms