Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp1P12032 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timp1P12032 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Timp1P12032 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timp1P12032 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timp1P12032 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp1P12032 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp1P12032 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp1P12032 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp1P12032 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp1P12032 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp1P12032 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp1P12032 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp1P12032 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms