Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Amd1P0DMN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amd1P0DMN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Amd1P0DMN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Amd1P0DMN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms