Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa5P09021 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa5P09021 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa5P09021 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms