Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp1P08042 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp1P08042 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp1P08042 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp1P08042 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp1P08042 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms