Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01674 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01674 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01674 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01674 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01674 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01674 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01674 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01674 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01674 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01674 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01674 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01674 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01674 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01674 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01674 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01674 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01674 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01674 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01674 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01674 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01674 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01674 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01674 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01674 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01674 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01674 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01674 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01674 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01674 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01674 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01674 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01674 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01674 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01674 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01674 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01674 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01674 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01674 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01674 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01674 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01674 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01674 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01674 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01674 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01674 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01674 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01674 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01674 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01674 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01674 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01674 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01674 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01674 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01674 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01674 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01674 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01674 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01674 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01674 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01674 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01674 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01674 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01674 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01674 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01674 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01674 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01674 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01674 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01674 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01674 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01674 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01674 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01674 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01674 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01674 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01674 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01674 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01674 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01674 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01674 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms