Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01669 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01669 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01669 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01669 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01669 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01669 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01669 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01669 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01669 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01669 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01669 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01669 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01669 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01669 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01669 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01669 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01669 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01669 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01669 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01669 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01669 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01669 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01669 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01669 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01669 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01669 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01669 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01669 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01669 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01669 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01669 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01669 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01669 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01669 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01669 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01669 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01669 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01669 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01669 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01669 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01669 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01669 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01669 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01669 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01669 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01669 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01669 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01669 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01669 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01669 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01669 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01669 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01669 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01669 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01669 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01669 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01669 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01669 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01669 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01669 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01669 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01669 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01669 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01669 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01669 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01669 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01669 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01669 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01669 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01669 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01669 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01669 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01669 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P01669 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01669 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01669 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01669 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01669 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01669 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01669 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01669 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01669 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01669 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01669 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01669 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01669 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms