Protein–RNA interactions for Protein: O88712

Ctbp1, C-terminal-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1O88712 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctbp1O88712 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctbp1O88712 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctbp1O88712 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctbp1O88712 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctbp1O88712 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctbp1O88712 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms