Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn2O88552 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn2O88552 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cldn2O88552 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn2O88552 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn2O88552 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms