Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt3aO88508 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnmt3aO88508 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt3aO88508 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3aO88508 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3aO88508 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3aO88508 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms