Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnk4O88454 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnk4O88454 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnk4O88454 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnk4O88454 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk4O88454 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk4O88454 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms