Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc4a4O88343 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slc4a4O88343 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc4a4O88343 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc4a4O88343 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc4a4O88343 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms