Protein–RNA interactions for Protein: O70517

Gm20767, Predicted gene, 20767, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20767O70517 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20767O70517 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20767O70517 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20767O70517 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20767O70517 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20767O70517 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms