Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51dO55230 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad51dO55230 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad51dO55230 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad51dO55230 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad51dO55230 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51dO55230 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rad51dO55230 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51dO55230 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51dO55230 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad51dO55230 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51dO55230 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51dO55230 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad51dO55230 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51dO55230 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51dO55230 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51dO55230 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad51dO55230 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51dO55230 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51dO55230 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51dO55230 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad51dO55230 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51dO55230 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51dO55230 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51dO55230 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad51dO55230 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms