Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a2O55192 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a2O55192 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a2O55192 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a2O55192 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms