Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2a2O55143 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a2O55143 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a2O55143 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2a2O55143 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms