Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mmp10O55123 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mmp10O55123 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Mmp10O55123 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmp10O55123 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mmp10O55123 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmp10O55123 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms