Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr1O55100 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr1O55100 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngr1O55100 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngr1O55100 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr1O55100 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms