Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnk2O54967 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnk2O54967 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnk2O54967 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnk2O54967 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnk2O54967 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms