Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkag1O54950 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkag1O54950 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkag1O54950 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkag1O54950 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkag1O54950 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms