Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs5O54928 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs5O54928 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs5O54928 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Socs5O54928 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs5O54928 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs5O54928 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs5O54928 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Socs5O54928 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Socs5O54928 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs5O54928 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs5O54928 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs5O54928 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Socs5O54928 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms