Protein–RNA interactions for Protein: O54885

Tyrobp, TYRO protein tyrosine kinase-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TyrobpO54885 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TyrobpO54885 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TyrobpO54885 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TyrobpO54885 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TyrobpO54885 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TyrobpO54885 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TyrobpO54885 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TyrobpO54885 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms