Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bnc1O35914 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bnc1O35914 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnc1O35914 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnc1O35914 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms