Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-ObO35424 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-ObO35424 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-ObO35424 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-ObO35424 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-ObO35424 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-ObO35424 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms