Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms