Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E1

Vmn2r44, Vomeronasal 2, receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r44L7N2E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r44L7N2E1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r44L7N2E1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r44L7N2E1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r44L7N2E1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r44L7N2E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms