Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc191J3QQ27 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc191J3QQ27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc191J3QQ27 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc191J3QQ27 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc191J3QQ27 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms