Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ5

Cfap73, Cilia- and flagella-associated protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap73J3QPZ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cfap73J3QPZ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfap73J3QPZ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap73J3QPZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap73J3QPZ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap73J3QPZ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap73J3QPZ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap73J3QPZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms