Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Gm20877J3QPZ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Gm20877J3QPZ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gm20877J3QPZ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gm20877J3QPZ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gm20877J3QPZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm20877J3QPZ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm20877J3QPZ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm20877J3QPZ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm20877J3QPZ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm20877J3QPZ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm20877J3QPZ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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