Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700122O11RikJ3QPW6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms