Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp870J3QMA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp870J3QMA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zfp870J3QMA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp870J3QMA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp870J3QMA4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp870J3QMA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp870J3QMA4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp870J3QMA4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms