Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930544D05RikJ3QK56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930544D05RikJ3QK56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930544D05RikJ3QK56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930544D05RikJ3QK56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930544D05RikJ3QK56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms